Let’s manipulate the Dataframe: COLONNE NON SEMPRE PRESENTI

OK passiamo alle altre 6 colonne che potrebbero non esserci. Iniziamo a cercarle! Per farlo useremo nuove strutture di Python, ma niente paura: ti spieghiamo tutto!

Supponiamo di voler cercare se nel nostro DataFrame df esiste una colonna che contiene l’informazione “Hands”, cioè il sito di campionamento del microbioma. Ma da dove arriva il valore “Hands”? L’abbiamo trovato nel paper! In pratica: per capire se esiste una colonna (in questo caso quella sul sito di campionamento) cerchiamo il valore indicato nel paper. Infatti il ragionamento che facciamo è il seguente: se dovesse esistere una colonna specifica sul sito di campionamento allora deve contenere il valore che è stato indicato nel paper.

#iniziamo con qualcosa che conosciamo già: creiamo una lista delle colonne del nostra DataFrame 
colonne = df.columns.to_list()

#NOVITÀ: creiamo una lista vuota che compileremo man mano
colonne_trovate = []

#NOVITÀ: CICLO FOR e CONDIZIONE IF
for colonna in colonne:
    if (df[colonna] == "Hands").any():
        colonne_trovate.append(colonna)
    else:
        pass

MMH con calma: cosa abbiamo visto a sinistra? Andiamo in ordine:

• Abbiamo creato una lista contenente i nomi delle colonne del nostro DataFrame df
• Abbiamo creato una lista vuota, perché intendiamo popolarla con i nomi delle colonne in cui troviamo il valore “Hands”
• Abbiamo utilizzato un ciclo for per considerare una colonna alla volta presente nella lista colonne
• Per ogni colonna abbiamo verificato con l’istruzione if se il termine “Hands” fosse presente in quella colonna. In particolare abbiamo cercato se fosse presente almeno una volta grazie al methodo .any()
• Se il valore “hands” è presente nella colonna, abbiamo usato il metodo .append() per appendere la colonna nella lista di colonne_trovate.
• Se il valore “hands” non è presente nella colonna, ndicato di passare alla prossima colonna senza aggiungere quella colonna alla lista colonne_trovate.

Nelle prossime slides ti spieghiamo meglio il funzionamento di for e if

for LOOP

Il loop for è una struttura molto utilizzate in Python. Questo loop consente di iterare in una serie di diversi elementi, come, nel nostro caso, gli elementi di una lista. Per capire il funzionamento di un ciclo for possiamo stampare l’elemento che viene preso in considerazione, così:

lista_parole = ["data", "hunters", "rock", "!"]
for parola in lista_parole:
    print(parola)

data
hunters
rock
!

Come hai visto, il ciclo for ha preso in considerazione un elemento (parola) alla volta dalla lista fornita (lista_parole), e ha eseguito il comando specificato dopo i due punti :, con l’indentazione corretta. In questo caso, il comando che gli abbiamo assegnato è stato quello di stampare la parola che stava considerando (print(parola)). Quindi:

• Step 1. parola = 'data'
• Step 2. parola = 'hunters'
• Step 3. parola = 'rock'
• Step 4. parola = '!'
• Finché non ci sono più elementi nella lista e quindi il loop è finito.

Tuttavia, dopo i due punti è possibile assegnargli qualsiasi altro comando!

Ad esempio, per curare i nostri metadati, gli abbiamo chiesto di verificare una condizione per ciascun elemento che stava considerando… (Cambia slide!)

if STATEMENT

L’istruzione if viene utilizzata per decidere se eseguire o meno determinati comandi. Quando si utilizza l’istruzione if, si valuta una condizione, ad esempio if 5 > 4, la quale può essere o vera o falsa. Se la condizione è vera, viene eseguito un blocco di comandi indentati sotto l’istruzione if. Se la condizione è falsa, viene eseguito un altro blocco di comandi che si trova dopo else:.

Lo schema generale è il seguente:

if condizione is True:
    fai qualcosa
else:
    fai qualcosa di diverso

Per esempio:

if 5 > 4:
    print("La matematica non è un'opinione!")
else:
    print("Wow, le leggi della fisica sono ormai ribaltate. Nulla ha più senso")

La matematica non è un'opinione!

Guarda l’esempio a lato: abbiamo richiesto di verificare la condizione “5 > 4”, cioè se 5 è maggiore di 4. Dal momento che questa condizione è vera, viene eseguito il blocco di comandi che si trova intendentato dopo l’if, cioè print("La matematica non è un'opinione!"). Solo nel caso in cui la condizione fosse stata falsa, sarebbe stato eseguito il comando sotto l’istruzione else:.

Let’s code